La función de los aisladores es direccional, como se descubrió en los experimentos con moscas de la fruta. gypsy se insertó en el locus amarillo y de Drosophila melanogaster, lo que resultó en la inactivación del gen y en algunos tejidos, pero el gen y todavía estaba activo en algunos tejidos, porque había una secuencia aislante en un extremo del gitano. gypsy tendrá diferentes efectos sobre la actividad del gen cuando gypsy se inserte en diferentes lugares en el locus y. Esto se debe a que la actividad del gen y está regulada por cuatro potenciadores. Cuando el aislante se inserta justo aguas arriba del promotor, bloquea la activación de los genes en los tejidos de la cutícula del cuerpo y la hoja del ala (del potenciador aguas arriba). Pero no bloqueó la expresión del gen y (del potenciador aguas abajo) en las cerdas y las garras farsales.
Dado que algunos potenciadores están aguas arriba y otros aguas abajo del promotor, el efecto del aislador no depende de la posición del aislador con respecto al promotor. Por lo tanto, la razón de la directividad del efecto aislante no se comprende realmente. Se ha encontrado que dos loci afectan la función del aislador en forma de transactivación. La nucleoproteína codificada por el gen S2J(Hw) reconoce el aislante, y solo después de que el aislante se une a él tiene un efecto aislante. Cuando este gen está mutado, el efecto de aislamiento se pierde a pesar de la inserción de un aislante en el locus y, y la y se expresa en todos los tejidos. Otro lugar es mod (mdg 4). Después de la mutación de este gen, su efecto es justo opuesto a Su(Hw), es decir, estos mutantes mejoran el efecto de aislamiento, haciendo que el efecto de aislamiento del aislante ya no sea direccional y se expanda, es decir, bloqueando el efecto de los potenciadores en ambos. lados aguas arriba y aguas abajo.
